Genotypisk bestämning av ESBL-producerande E. coli isolerade i Kronobergs län 2009
Vanlig tarmbakterie som Escherichia coli (E. coli) kan bland annat orsaka infektioner i bukhålan och urinvägsinfektioner. Infektioner orsakade av bakterien har ofta behandlats med betalaktamantibiotika, som penicilliner och cefalosporiner, vilket har resulterat i selektion av antibiotikaresistenta bakterier. Extended-Spectrum Beta-Lactamases (ESBL) är enzymer som hydrolyserar 3:e generationens cefalosporiner som cefotaxim, ceftazidim och ceftriaxon, men kan även bryta ner penicilliner, monobaktamer och övriga cefalosporiner. ESBL förekommer främst hos E. coli och Klebsiella pneumoniae. I början utgjordes ESBL-enzymerna av TEM och SHV, men idag är CTX-M den vanligaste ESBL-varianten. CTX-M genen finns i över 50 olika varianter, vilka delas in i fem subgrupper (CTX-M-1, CTX-M-2, CTX-M-8, CTX-M-9 och CTX-M-25). Syfte med arbetet var att utföra en genotypisk bestämning av ESBL-producerande E. coli, som isolerats i Kronobergs län 2009, med hjälp av realtids-PCR (Polymerase Chain Reaction). För detektion av CTX-M användes multiplex-realtids-PCR med vilken de fem olika grupperna kunde detekteras under samma PCR-analys. Resultatet visade att den vanligaste ESBL-varianten bland ESBL-producerande E. coli i Kronobergs län 2009 var CTX-M-1 (88 positiva av 123), men ett stort antal var positiva både för CTX-M-1 och TEM (41 isolat). Den minst förekommande varianten visade sig vara SHV (2 isolat). En ökad antibiotikaresistens kan leda till svårigheter att behandla vissa vanliga infektioner som urinvägsinfektioner och infektioner efter bukoperationer. Med tanke på att E. coli är en vanlig tarmbakterie är det viktigt att motverka uppkomst och spridning av ESBL. En genotypisk karaktärisering av förekommande ESBL-stammar i Kronoberg är därför en viktig del av övervakningen.