Utveckling av 2D-gelelektrofores för alkaliska proteiner i Ideonella dechloratans
En jämförelse mellan aeroba och anaeroba odlingsförhållanden
De flesta klorater som finns i naturen kommer från utsläpp av människan i flera storaindustrier. Kloraterna påverkar flera olika levande organismer och det är därför viktigt att tahand om dem efter utsläppen. Flera olika bakterier kan bryta ned klorat till klorid och syre, enav dessa är Ideonella dechloratans. Nedbrytningen sker med de alkaliska enzymernakloratreduktas och kloritdismutas under anaeroba förhållanden. I detta arbete har 2Dgelelektrofores utvecklats för alkaliska proteiner i Ideonella dechloratans i syfte att kunnajämföra proteinuttryck under olika odlingsförhållanden. Därefter har en jämförelse mellanaeroba och anaeroba odlingsförhållanden gjorts samt försök att detektera kloritdismutas.Resultatet har blivit att en metod har tagits fram som ger en hög grad av upplösning pågelerna från 2D-gelelektroforesen. Jämförelserna mellan aeroba och anaerobaodlingsförhållanden har visat att det finns stora skillnader i proteinuttryck mellan de bådaodlingsförhållandena. Fler proteiner syns i området pH 8-10 under anaerobaodlingsförhållanden jämfört med aeroba förhållanden. Försök till identifiering avkloritdismutas har gjorts för de anaeroba odlingsförhållandena, dock krävs det ytterligarearbete innan en säker identifiering kan göras.