Microarrays som detektionsmetod av bakteriella patogener i livsmedel
Bakteriella patogener i livsmedel är en av de vanligaste orsakerna till sjukdom hos människa
och djur världen över, därför är tillverkning av säkrare livsmedel en viktig uppgift. I dagsläget
används oftast odling på selektiva substrat av bakterier för att påvisa patogener och
tidsåtgången kan vara upp till en vecka. En molekylärbiologisk metod som kan minska
tidsåtgången är microarrays, där detekteras målorganismen på DNA- eller RNA-nivå.
Enkelsträngade oligonukleotider, så kallade sonder, tillverkas dit bakteriegenom, templat,
hybridiseras. Sonderna designas så att de är specifika för de bakterier som ska påvisas och
fästs i mikroformat på en mikromatris tillsammans med upp till tusentals andra sonder.
Templatet som ska hybridiseras till sonden anrikas ofta för att sedan amplifieras via
polymeraskedjereaktion. Templaten färgas in för att en scanner ska kunna avläsa resultaten av
vilka templat som hybridiserats till vilka sonder och därmed påvisa bakteriella patogener.
Syftet med den här uppsatsen är att ta reda på hur microarrays kan användas för att detektera
bakteriella patogener i livsmedel och om tidsåtgången kan minskas. Bakterien Listeria
monocytogenes används som modellpatogen, då det är en patogen som kan ge upphov till
sjukdom hos människor och djur även i låg förekomst.