Analys av NK-cellers migration och interaktion med målceller
Denna rapport kommer att redogöra för NK-cellers (Naturliga mördarceller) beteende vid odopat tillstånd. Det vi kallar dopning är när NK-celler aktiveras genom interleukin-2, detta är en signalerande molekyl i vårt immunsystem som reglerar aktiviteten hos vita blodkroppar vilka utgör en del av immunförsvaret.Med hjälp av ett par mikroskopfilmer har vi kunnat följa varje enskild NK-cells migration(rörelse) och interaktion med våra målceller i ett prov under en 8-timmars period. De målceller vi använder är en sorts tumörceller, HEK 293T(Human embryonic kidney 293T cells. Vi har valt att spåra cellerna manuellt med ett program kallat ImageJ och automatiskt med ett matlabprogram, Baxter algorithm. Anledningen till att vi dessutom valt att spåra automatiskt är för att kunna avgöra hur väl detta program kan spåra celler. Sedermera har vi beräknat alla cellers hastigheter, både medelhastigheter och hastigheter de har i olika tillstånd. Slutligen har vi kunnat jämföra våra odopade NK-celler med en uppsättning av väsentligt mer aktiva(dopade) NK-celler.Det första vi konstaterade är att våra odopade NK-celler endast dödade ett par tumörceller. Vilket fick oss att lägga vårt fokus på analys som inte berör det. Vi fann att det t.ex. existerar klara fördelningar av hastigheten, både för medelhastigheten och hastigheten de har i olika tillstånd. Definitionen av tillstånden är kort sammanfattat i del 2.3.1 med referens för exakt definition. Liknande resultat har vi fått fram gällande interaktionsanalysen. Vidare har vi kommit fram till att automatisk spårning med hjälp av ett speciellt dataprogram inte är optimalt när man har ett litet prov, men att det kan vara användbart vid analys av stora mängder data när manuell spårning är ineffektivt. Däremot anser vi att det kräver ett reproducerbart experiment med hållbar bildkvalité. Det bör även nämnas att Baxter algorithm är ett program som ursprungligen skapades för att spåra stamceller.Jämförelsen mellan de odopade och dopade NK-cellerna gav oss att fördelningarna i hastigheter skilde sig. Majoriteten av de odopade cellernas medelhastigheter låg inom ett mindre intervall, 1.0-2.2 ?m/min, och de dopade cellernas inom ett större intervall, 0.6-2.6 ?m/min. Det kan bero på skillnaden i antal celler i de olika proven och att det är osäkert hur många av cellerna som reagerat på IL-2.