Background: Hepatitis E (HEV) is a small, non-enveloped virus that belongs to the viral genus Hepevirus. HEV is a positive sense single-stranded RNA virus and there is insufficient information regarding its replication. This is mainly because the virus has low capacity to grow in normally used cell cultures. Many specific strand assay detection studies have been done in order to understand more about HEV replication. Unfortunately, these assays have the disadvantage of giving false positive results.Aim: The aim of this project was to improve the positive strand assay to increase specificity and eliminate false positivity which is due to high sensitivity of the polymerase chain reaction (PCR).

Bovine Respiratory Syncytial Virus (BRSV) is a common cause of respiratory disease among young cattle. The virus causes severe losses; the herd mortality rate can sometimes be as high as 20 %. In this study the avidity (i.e the antigen binding force) of BRSV specific antibodies was measured to see if there was a difference between antibodies produced during an acute phase of infection and antibodies produced by earlier infected animals. A commercially available ELISA-testkit against BRSV-specific antibodies was used and an incubation step with 6M urea was added. The effect of the urea is that it breaks the weak bonds between antibodies and antigen while the stronger bonds remain intact. Four different groups of animals were included in this study; seven calves that were naturally infected, three acutely infected calves with known time of infection, five cows that were seropositive during several years and four experimentally infected calves that had been a part of a vaccine trial. The results of this study showed that antibodies produced during the acute phase of an infection had a low avidity and that the avidity increased with time after infection.

Background: As a part of a national health control program, Statens VeterinärmedicinskaAnstalt performs diagnostics to screen flocks for certain pathogens causing high mortality,morbidity and/or serious economical losses. There are several viruses in the programincluding IBDV (infectious bursal disease virus), IBV (infectious bronchitis virus) and NDV(Newcastle disease virus). Method: 96 serum samples were collected from different poultryflocks in Sweden and analyzed by ELISA, which are currently used in the health controlprogram as well as by a commercial prototype of a multiplex immunoassay manufactured byLuminex Corp., which is currently under evaluation at the United States Department ofAgriculture USDA. This 4-plex assay detects antibodies for the three above-mentionedviruses as well as antibodies of avian reovirus. In the context of this study the ELISAs run inroutine diagnostics as well as a REO ELISA were used as the standard for comparison.Result: The antibody concentration in serum from vaccinated chickens was high while theantibody concentration level in serum from not vaccinated chickens was low.

The Swine flu (H1N1) erupted in 2009 and wasquickly spread over the world and developed into a pandemic, with a great threat against people?s health. It was soon discovered that the H1N1?virus had a different character than the seasonal flu, since it especially affected younger individuals and the consequences from the disease were expected to be more severe. In Sweden it was decided to provide a free of charge vaccination against the H1N1-virus, and the Swedish vaccination ratiobecome relatively high compared to other countries.

Background: Infection with Human Papillomavirus, HPV, is one of the world's most common sexual transmitted infections. The virus causes genital warts (condyloma) but certain virus types can cause cancer. The most common cancer type caused by the virus is cancer of the cervix. Nowadays there is a screening program for women between 23 and 60 years of age where Pap smears of the cervix is taken to discover abnormalities at an early stage. Cervical cancer is very common all over the world and this screening program saves many lives, but not in the less developed countries since the screening program is too expensive.

Canine herpes virus 1 (CHV-1) är en vitt utbredd smittsam patogen. Viruset tycks verka enzootiskt i hundpopulationer och ger upphov till en livslång latens hos infekterade djur. CHV-1 kan sedan reaktiveras vid exempelvis stress, som vid dräktighet. Hos vuxna hundar får infektionen ofta ett subkliniskt uttryck, men kan också ge upphov till respiratoriska symtom samt genitala blåsor och ögoninfektioner. Dräktiga tikar kan drabbas av fertilitetsproblem, med mumifikation, resorption, dödfödsel samt abort av foster.

Vectors based on lentivirus backbones have revolutionized our ability to transfer genesinto many cell types. Lentiviral vectors integrate into the chromatin of target cells and do not transfer any viral genes causing vector replication. Both of these features arecommonly used in gene therapy and have been used clinically in individuals sufferingfrom cancer, infections and genetic diseases. It has been discovered that T-cells can be genetically modified to be used as effective weapons against cancer: therefore virus mustbe produced to deliver the gene of interest into the T-cells. In this project, lentiviralvectors have been produced to transfer the gene coding for a chimeric antigen receptor(CAR) which is directed to CD19 on B-cells.

Luftvägssjukdomar är ett av de vanligaste hälsoproblemen hos kalvar och utgör en betydande kostnad för branschen. Luftvägssjukdomar är komplexa till sin natur och uppkommer endast då en kombination av faktorer som inkluderar djuret, miljön och infektiösa agens förekom-mer. Ofta är den primära patogenen ett virus och den påföljande lunginflammationen orsakas av bakterier. Ett bidragande virus, BVDV, har genom ett frivilligt kontrollprogram utrotats i Norden och det finns potential att utrota även BRSV. Genom en ökad förståelse för biosäker-het och hur ventilation av mikromiljöer, gruppstorlek och ålderssammansättning påverkar smittrycket och luftvägshälsan hos kalvar kan byggnader och management-rutiner som mini-merar risken för respiratoriska sjukdomar utformas..

Peste des petits ruminants (PPR) är en epizootisjukdom som drabbar små idisslare. Sjukdomen är obotlig, ger allvarliga symptom och har i regel hög morbiditet och mortalitet. Orsakande agens är peste des petits ruminants virus (PPRV) som tillhör familjen Paramyxoviridae och genus Morbillivirus. PPR breder ut sig i flera utvecklingsländer i framför allt Afrika, Mellanöstern och Asien. Sjukdomen orsakar stora ekonomiska förluster för lantbrukare och bidrar därmed till fattigdom.

This paper shortly describes the coronavirus family, bovine corona viruses (BCV) properties and two diseases that BCV causes, winter dysentery and calf diarrhoea. The purpose of the study was to compare different diagnostic methods to detect BCV. Different methods are discussed, PCR, ELISA, immunofluorescense and virus isolation. Investigations were made in three different herds with winter dysentery; one dairy cattle farm with about 100 cows of different ages, one testing station for bulls with about 150 bulls and another small dairy cattle farm with 26 cows and 20 replacement heifers and calves. Faeces and nasal swabs were analysed with PCR and ELISA. The result shows that PCR seems to be a reliable method for detecting BCV but that the ELISA test can not be used as a reliable diagnostic method to analyse samples from animals with winter dysentery..

Abort som orsakas av virus förekommer hos hästar över hela världen, och skapar problem för uppfödare. De främsta bakomliggande virusen är ekvint herpesvirus 1 (EHV-1) och ekvint arterit virus (EAV). Fall inträffar tillföljd av båda virusen varje år i Sverige, och framförallt EHV-1 har varit föremål för mycket forskning för att hitta ett skyddande vaccin. Det finns i Sverige ett avdödat vaccin mot EHV-1 upptaget i FASS. EAV däremot vaccineras det i princip inte mot i landet, men utomlands finns och används i vissa länder både avdödade och attenuerade levande vaccin.

Rabies kan delas in i två former, en paralytisk och en furiös form. Immunförsvaret spelar med största sannolikhet en roll vid paralytisk form hos mus, genom till exempel T-lymfocyter, och skador ses i både CNS och PNS. Hur dessa T-celler verkar är dock fortfarande oklart, men det har visats att ett intakt immunförsvar ger den paralytiska formen hos mus. Vid avsaknad av paralys hos mus, står antagligen viruset för de främsta skadorna, som finns i hjärnan, men immunsuppression bidrar också.Hos människa visar studier tvetydiga resultat. Skador har setts både i CNS och PNS vid paralytisk form medan man vid furiös form har sett skador enbart i CNS.

Hemagglutinin är ett transmembranprotein som finns i membranet hos influensaviruset. Detta protein avgör virusets infektiösa förmåga. För att förstå influensaviruset bättre och kunna hitta nya detektionsmetoder för aktiva influensavirus krävs en första framrening av proteinet. Målet med denna studie är därför att överlämna ett protokoll till beställaren med fullständig process på hur hemagglutinin kan renas fram från aktiva virus.Resultatet har erhållits genom en omfattande litteraturstudie där information har samlats från skriftliga och elektroniska källor, samt via intervjuer med sakkunniga forskare.Processen att rena fram hemagglutinin börjar med kultivering av virus i cellinjen MDCK följt av virusisolering med hjälp av centrifugering. Virusmembranet löses sedan upp och det membranbundna hemagglutininet solubiliseras.

Denna rapport beskriver de behov vilka ligger tillgrund för att skapa en IT-säkerhetsdatabas. Rapporten tar även upp olika IT-säkerhetsproblem och för en diskussion om vad som är faran med dessa problem. Diskussionen förs inom två områden rörande IT-säkerhet.Det ena området är om IT-säkerhet i allmänhet och tar upp begreppet CIA. CIA står för de engelska begreppen Confidentiality, Integrity och Availability och på svenska, sekretess, integritet och tillgänglighet.Den andra delen handlar om lite mer specifika IT-säkerhetsproblem, som till exempel virus och sniffing.På uppdrag av FOI är en databas, vilken är avsedd för att lagra information rörande IT-säkerhet, skapad. Rapporten tar upp en del grundläggande databasteori och beskriver designen och implementationen av databasen.

Hepatit B är en virusinfektion som orsaks av Hepatit B virus (HBV). Hos de flesta människor orsakar detta virus inte några större problem men hos cirka 5-10% av de drabbade utvecklas en kronisk form som kan vara allvarlig. Detta beror på att vid den kroniska formen finns det en risk att levercirrhos och hepatocellulärt carcinom utvecklas. Idag finns det effektiv men ej botande behandling mot kronisk hepatit B. Målen vid behandlingen av kronisk hepatit B är att minimera risken för utveckling av cirrhos, leversvikt och hepatocellulärt carcinom, vilket görs genom inhibering av HBV virusreplikation.